Desde el año 2021, el museo custodia la biblioteca del destacado arqueólogo y antropólogo, Francisco Iriarte Brenner y la destacada bailarina de folklore, docente y psicóloga, Milly Ahon Olguín. La colección está compuesta por cuadernos de campo y libros de la autoría de ambos personajes, así como en temas de arqueología, antropología, museografía, folklore, fotografías y material audiovisual.